El término municipal de Hinojosa de Duero se localiza en el extremo del occidente castellanoleonés, a 105 kilómetros de la capital salmantina, y pertenece a la comarca del Abadengo. Como tal participa de las singulares características topográficas introducidas por la red fluvial en el tramo fronterizo con Portugal, la "raya húmeda", y mantiene una estrecha relación con los municipios de La Ribera o de Las Arribes del Duero y con las frei-guesias portuguesas situadas más allá del Duero. Los aspectos naturales del "arribe", como el clima, la vegetación o el paisaje, son semejantes a los de sus vecinos y con ellos comparte, asimismo, rasgos comunes en el habla y ancestrales costumbres. Por tanto, Hinojosa de Duero, con sus 92,60 Km2 de superficie municipal, es la puerta sur de Las Arribes y el paso hacia el concelho portugués de Freixo de Espada a Cinta.

El encajamiento del río Duero, que en este sector discurre por debajo de los 140 m, ha obligado a los ríos y arroyos tributarios a precipitarse en su búsqueda desde las tierras altas -685 m en el Tesito de los Cuatro Términos-. El río Huebra, el río Camaces, la Rivera de Froya y el río Morgáez, que vierte en el río Águeda a 180 m, salvan este escalón ahondando su cauce entre paredes semiverticales y saltando en un sinfín de cascadas y grandes cachones. Las quebradas de los ríos sirven, además, de refugio a una rica y abundante avifauna. El buitre leonado, el alimoche, el águila perdicera, el buho real o el avión roquero, asientan sus nidos en los farallones de esta Zona de Especial Protección para las Aves (ZEPA-118), incluida en la Red de Espacios Naturales Protegidos de Castilla y León.